水波纹也是瘿子的一种表现形式。从水波纹的名字当中我们就可以大概知道，呈现出石头扔到水里荡起的水波的那种感觉体现在紫檀上，也可以描述为绸缎在灯光下反射出的样子。
小叶紫檀水波纹是紫檀里面最漂亮而且不容易开裂的一种纹理，像瘤疤纹理也非常漂亮，但是瘤疤由于密度不均匀，很容易开裂，而水波纹不会出现这种情况。
对于水波纹的形成，存在着一种普遍的说法，即随着树木的生长，根部承受树干的重量致使木质纤维被挤压，逐渐形成了水波纹。正因如此，通常水波纹的木料密度和油性都比较好，荧光感也较强。
常玩木串的朋友们可能都知道，木质在受到盘玩或自然氧化之后会逐渐变黑，那么我们所说的水波纹是否也会受到影响而变没了呢?答案是否定的。我们从几张图看看自然氧化之后的水波纹效果。
由上图不难看出，氧化之后的水波纹小叶紫檀仍然能显现出波光纹理，在紫红色木质的映衬下，整件紫檀制品更附有神秘感。
水波纹木材的产量相比顺纹要少的多。这可以从水波纹的形成条件看出。由于生有“水波纹”的地方，大多在树木的根部。其原因主要是因为生长环境恶劣，导致树木生长过程中受到挤压，从而逐渐形成类似水波的纹理。打个比方，如果树木在生长过程中遇到乱石的阻碍，其生长路线就会改变，从而导致木质的纹理改变形成水波纹。这也是树木在病态的一种体现，大多出现在野生林中，在人工林甚为稀少。
根据水波纹路的不同也存在着档次的划分。一般点的水波纹纹路较粗，也比较无序。在市场上的水波纹手串中比较常见，如下图。
高端的水波纹纹理较细且整齐，波纹越细越说明取材的部位就在树根最底下，密度也是一棵树密度最大的地方。这种纹路的原材料相对稀少。